На правом берегу реки Северки Коломенского района Московской области в сельском поселении Непецинское расположено небольшое, по современным меркам (112 человек согласно переписи 2005 г.), село Шкинь. Слово «Шкинь» в переводе с финно-угорского языка означает «временное поселение».

Первое упоминание о селе Шкинь относится к 15 веку. По духовной грамоте великого князя Василия Васильевича Темного (1461 г. мая 3-1462 г. марта 27) «село Шкинь и з деревнями» отходит его жене, дочери малоярославецкого князя Ярослава Владимировича великой княгине Марии (ум. 1484). После ликвидации удельной системы в 1490 г. село снова стало великокняжеским. Необходимо отметить, что памятник древнее, чем могут свидетельствовать письменные источники, еще в 11-13 веках здесь существовало селище, о чем свидетельствуют фрагменты древнерусской гончарной керамики с линейным и волнистым орнаментом.

В 1671 г. село Шкинь с деревнями за подавление разинского мятежа было пожаловано выдающемуся полководцу князю Юрию Алексеевичу Долкорукову (начало 17 века – 15 мая 1682 г.). Село довольно долго находилось в руках этой семьи. В 18 веке в Шкини 507 муж.душ+324 жен.душ; владельцы – князья Василий и Юрий Владимировичи Долкоруковы.

Согласно документам в 18 веке в этом богатом торговом селе располагалась церковь Архистратига Божия Михаила. По межевым записям на 12 октября 1767 г. храму принадлежало «Пашня 50 д 212 с, дороги 1 д 300 с, селение 2275 с, всего 52 д 387 с, … Сенной покос 5 д 2039 с.». Село в это время было общим владением семьи Приклонских и княгини Федосьи Володимеровны, вдовы премьер-майора князя Александра Алексеевича Долгорукова и жены статского советника князя Ивана Андреевича Друцкого-Соколинского.

В конце 18 века село приобретает инженер-генерал-поручик Илья Александрович Бибиков (1698-1784).

У Ильи Александровича от второго брака с Варварой Никитичной Шишковой родился сын Гавриил (ум.1803), строитель церкви во имя Сошествия Святого Духа в селе Шкинь.

Гаврила Ильич прославился не только как участник Суворовских походов, но и как меценат. Гавриле Ильичу принадлежала подмосковная усадьба Гребнево, получившая название  Гребневский Парнас. Здесь бывали знаменитые поэты: Державин, Княжин, Херасков, Тредьяковский. В поместье существовал театр, руководимый известным крепостным дирижером и композитором Даниилом Кашиным.

Похоронен Гаврила Ильич в московском Новодевичьем монастыре. По заказу его жены, Екатерины Александровны, в девичестве Чебышевой (1766-1833), на памятнике была высечена эпитафия:

Сей хладный камень покрывает
Прах тленный одного из тех мужей,
Каких Творец, как дар, на землю посылает
Для благоденствия, для радости людей.
Геройство, тонкий ум, небесна добродетель,
Чистейшей веры огнь в душе его горел,
Супруг, отец и друг, несчастных благодетель
Искал он вечности, искал и приобрел.
С его потерею все горести постигли
Супругу нежную и с ней двенадцать чад
Она с потоком слез сей памятник воздвигла.
Дай Боже помощь им, лишенных всех отрад.

Двенадцать детей это: Дмитрий (киевский генерал-губернатор), Павел (генерал-майор, погиб в 1812 г.), Гавриил (тайный советник), Илья ( генерал-адъютант, генерал-губернатор Виленский), Александра, Анна, София, Екатерина, Мария, Вера, Александра, имя одного ребенка не установлено.

В конце 18-начале 19 веков Гаврила Ильич перевел своих крепостных на оброк, что не могло не сказаться на их благосостоянии: «Крестьяне на оброке, упражняются хлебопашеством, а промысл имеют извозом по разным дорогам, имуществом довольно зажиточны». Известно, что дед одного из удачливых дельцов, действительного статского советника, подрядчика железнодорожного строительства, П.И.Губонина (1825-1894), происходивший из села Борисова, на противоположном от Шкини берегу Северки, в конце 18 века освоил ремесло камнетёса и камнереза, которое затем передал сыну Иону, устроившему камнетесную мастерскую недалеко от Подольска. Можно предположить, что безымянный Губонин осваивал, как и многие другие мужики из окрестных деревень, новое для себя дело на строительстве шкиньского храма.

От бывшей усадьбы Шкинь до сегодняшнего дня сохранилась только церковь во имя Сошествия Святого Духа, фигурирующая в документах так же как Церковь Сошествия святого Духа на Апостолов, Святодуховская церковь, Духосошественская церковь. Закладка первого, вероятно деревянного, храма датируется еще 15 веком.

В 1794-1800 годах на средства Г.И.Бибикова и семьи Приклонских в Шкини на месте ветхой деревянной церкви Михаила Архангела возводится новый каменный храм. Храмозданную генерал Бибиков получил 25 августа 1794 г. от епископа Коломенского Афанасия. В современной литературе автором проекта называют московского архитектора Родиона Родионовича Казакова (1758-1803), ставшего к этому времени автором свыше тридцати зданий в Москве и области, но это не единственное существующее предположение. В любом случае все исследователи, какую бы точку зрения они не отстаивали, соглашаются с тем, что проект был заказан выдающемуся мастеру.

В качестве возможных претендентов на авторство указываются В.И.Баженов, Р.Р.Казаков, Николя Н. Легран, И.И.Ветер (Ветров) и С.В.Грознов (Грязнов).

Отсутствие документов привело к тому, что в качестве доказательства авторства того или иного архитектора исследователи привлекают внешнее сходство памятников, приписываемых им.

В исторической литературе прототипом Духосошественной церкви принято называть собор Александро-Невской лавры (1778-1790 гг., И.Е.Старов). Однако использованная Старовым базиликальная схема храма в Шкини была несколько преобразована – нефы были заменены на два самостоятельных теплых придела – Михаила Архангела и Николая Чудотворца.

На аттике, венчающем портик западной паперти, сохранились стержни, на которых, возможно, по предположению С.П.Орловского, были установлены скульптуры. Такое решение является косвенным свидетельством принадлежности проекта В.И.Баженову, часто использовавшему оригинальные, не характерные для русского зодчества формы, к тому же из существующих двух колокольных церквей большая часть приписывается именно ему.

В плане храма во имя Сошествия Святого Духа – латинский крест. Рукава креста на фасадах украшены дорическим портиком с высокими фронтонами. Венчает храм громадная ротонда с большим куполом, поставленным на средокрестие. На куполе ротонды сохранилась белокаменная корона. Храм обнесен двадцатью белокаменными колоннами, распределенными между алтарным выступом, западным входом и боковыми портиками. Лоджию западного портика франкируют парные колокольни, что делает этот фасад особенно выразительным.

Работа по возведению храма проводилась под наблюдением московского губернского архитектора Ивана Андреевича Селехова (1796, Половцев), автора проекта Московской Городской больницы им.Гиляровского (1804-1808). Документы этого времени в архивах не обнаружены, возможно, это связано с упразднением в 1799 г. Коломенской епархии и передачи ее диоцеза Москве, где митрополит получил титул «Московского и Коломенского».

Село постепенно увеличивалось: в 1852 г. оно насчитывало 99 дворов, к 1862 г. уже 101 двор с населением 758 человек, помимо церкви в селе были открыты две фабрики. В 1879 г. в селе появился приемный медицинский покой, один из трех наряду с селами Малино и Бояркино, сменивший «разъездной фельдшеризм».

С 19-20 веков в селе сохранился каменный дом и хозяйственная постройка, принадлежавшие купцу Квасову. Они находятся на одной улице с храмом ближе к реке. Сохранился мост, также построенный в 19 веке.

В 1906 году на место священника был определен Михаил Михайлович Остроумов, сын священника Коломенского уезда. В 1901-1902 гг. после окончания Московской Духовной семинарии он занимал должность надзирателя в Коломенском духовном училище, после был назначен учителем церковного пения и чистописания в Коломенском училище. В декабре 1906 г. был рукоположен в диаконы и сразу же в священники. С 1907 г. стал преподавать в Шкиньской земской школе. Его заслуги перед приходом были отмечены в 1910 г. награждением набедренником, в 1914 г. – скуфьей. Известны имена и других церковных людей того периода: диаконом на псаломщицкой вакансии служил Михаил Иванович Воинов, а церковным старостой с 1905 г. числился крестьянин села Шкинь Дмитрий Иванович Трушкин.

В 1911 г. в селе была усадьба И.В.Добрынина (или по другим источникам – И.В.Добрышкина).

Перипетии двадцатого века не могли обойти Шкинь стороной. В расстрельных списках фигурируют имена уроженцев этого небольшого села. В книге памяти московской области есть скупая запись о Воинове Василии Михайловиче: «Родился в 1890 г., Московская обл., с.Шкинь; служитель религиозного культа. Проживал: Московская обл., с.Шкинь».

В 1936 г. храм был закрыт. В советский период погибли иконостас и большая часть лепного убранства. По воспоминаниям местной жительницы разграбление церкви началось после войны.

В 1960-х гг. здесь устроили склад.

В 1966 г. под наблюдением архитектора М.Б.Чернышова была произведена консервация памятника, а в 1975 г. архитектор Орловский С.П. должен был разработать проект реставрации. После переезда треста «Мособлстройреставрация» из Сретенского монастыря документы архивов и производственного бюро были утеряны.

Возрождение Свято-духовской общины связывают с обретением в 1991 г. одной из жительниц села Шкинь, Серафимой Ивиной, чудотворного образа преподобного Серафима Саровского, спрятанного на одном из чердаков. В 1992 г. Святодуховская церковь была передана Русской Православной Церкви, и 7 апреля 1996 г. в день Благовещения Пресвятой Богородицы в Никольском приделе было совершено первое за долгое время богослужение. С 2003 г., 100-летнего юбилея Серафима Саровского, службы совершались в южном приделе.

В 2014 году произошло значимое событие для Свято-Духовского храма. По благословению митрополита Крутицкого и Коломенского Ювеналия 14 апреля состоялось первое учредительное собрание Попечительского совета под председательством заместителя полномочного представителя президента Российской Федерации в Центральном федеральном округе Николая Павловича Овсиенко. Целью Совета стало содействие реставрации храма и его развитие как культурно-исторического объекта. Самыми активными темпами начались восстановительные работы.

2015 год – подъем колоколов на звонницу.

2016 – Великое освящение Никольского придела.

5 июня 2017 года Великое Освящение храма.

В 2020 году на площади перед храмом был открыт десятиметровый обелиск основателям и владельцам села Шкинь русскому дворянскому роду Бибиковых. Среди них были генералы, герои войн, генерал-губернаторы, все они внесли достойный вклад в историю России.

2021 год закончена роспись храма.

2023 год Установлены и освящены иконостасы в приделах Николая Чудотворца и Архистратига Михаила.